ID   HTH_TETR_FAMILY; MATRIX.
AC   ZZ99999;
DT   Tue Jun 17 10:12:19 2003
DE   Bacterial regulatory proteins, tetR family DNA-binding domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.8123661; R2=0.0196290; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=392; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=290; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-6; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-3,1,-20,1,4,-24,-10,4,-19,15,-18,-14,3,-5,12,19,0,0,-16,-28,-16,7;
MA   /M: SY='E'; M=1,11,-22,17,19,-31,-7,3,-23,9,-23,-16,7,-5,13,6,1,1,-16,-37,-23,15;
MA   /M: SY='Q'; M=0,7,-19,9,12,-30,-6,5,-21,15,-21,-15,7,-5,16,16,2,2,-17,-33,-21,12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-26,-11,-35,-26,10,-36,-18,30,-17,27,20,-26,-24,-18,-17,-17,-7,23,-18,-7,-18;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-26,-15,-36,-26,15,-38,-16,27,-17,30,23,-26,-23,-17,-18,-18,-9,19,-13,0,-18;
MA   /M: SY='D'; M=2,11,-18,15,14,-29,-5,2,-22,6,-22,-15,10,-5,10,2,4,3,-15,-36,-21,12;
MA   /M: SY='A'; M=12,-2,-4,-3,-2,-19,-3,-7,-8,-1,-9,-8,-1,-4,-1,-7,7,7,-1,-36,-19,-1;
MA   /M: SY='A'; M=14,-3,-4,-4,-4,-19,1,-10,-9,-3,-8,-8,-3,-4,-3,-10,7,8,-1,-36,-19,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-12,-14,-16,-10,-3,-24,-8,6,-5,8,7,-12,-14,-5,-5,-7,-2,5,-22,-10,-6;
MA   /M: SY='E'; M=0,6,-19,9,10,-28,-6,-1,-18,8,-19,-14,4,-7,9,9,1,2,-13,-34,-22,10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-19,-5,-26,-18,4,-30,-13,15,-14,19,16,-19,-16,-11,-14,-11,-4,12,-18,-6,-12;
MA   /M: SY='F'; M=-11,-27,-9,-37,-31,32,-40,-12,20,-22,26,22,-27,-27,-22,-23,-20,-11,13,4,14,-22;
MA   /M: SY='A'; M=1,-4,-12,-6,-3,-14,-12,-3,-7,-1,-6,-4,-2,-10,0,-3,0,1,-4,-25,-12,-1;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=0,11,-23,16,20,-31,-9,2,-22,11,-22,-15,7,-2,16,10,0,1,-17,-34,-23,17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-1,-14,-2,2,-13,-16,10,-15,10,-14,-9,2,-12,8,12,-3,-2,-13,-19,-3,4;
MA   /M: SY='G'; M=2,1,-18,2,-6,-45,51,-9,-36,-8,-35,-34,1,-11,-7,-9,2,-5,-26,-40,-36,-7;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-18,-9,-25,-21,23,-33,0,2,-17,7,6,-16,-14,-15,-18,-15,-10,0,4,25,-15; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=3,8,-15,11,9,-22,-4,3,-19,3,-19,-13,7,-7,6,-1,2,2,-13,-33,-16,7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=4,5,-15,7,5,-30,6,2,-23,6,-23,-19,6,-5,6,6,5,3,-16,-36,-22,5;
MA   /M: SY='L'; M=-1,-16,-8,-21,-16,-1,-23,-11,12,-11,13,9,-16,-14,-11,-11,-4,1,12,-24,-10,-11;
MA   /M: SY='S'; M=8,0,-5,0,-2,-26,3,-2,-16,-2,-16,-13,3,-4,-2,-2,15,14,-7,-35,-22,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-18,-8,-25,-18,5,-30,-11,18,-12,19,18,-18,-16,-12,-15,-6,-1,17,-22,-7,-12;
MA   /M: SY='K'; M=2,6,-17,6,6,-27,-6,1,-20,9,-19,-14,7,-3,9,9,4,3,-14,-34,-20,7;
MA   /M: SY='E'; M=0,8,-23,12,15,-27,-8,-1,-19,6,-17,-11,4,-8,11,3,-2,-1,-14,-35,-22,12;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-10,-36,-27,9,-36,-20,34,-19,29,21,-27,-24,-19,-20,-17,-7,26,-21,-8,-19;
MA   /M: SY='A'; M=13,-5,4,-8,-6,-16,-6,-11,-3,-6,-5,-4,-5,-6,-5,-12,6,7,4,-35,-17,-5;
MA   /M: SY='R'; M=3,6,-19,9,11,-30,-5,3,-21,15,-21,-16,6,-6,13,16,3,3,-16,-36,-23,11;
MA   /M: SY='K'; M=1,3,-16,3,7,-21,-11,3,-16,8,-15,-11,4,-7,8,7,2,2,-11,-28,-14,8;
MA   /M: SY='A'; M=9,-8,4,-12,-9,-12,-12,-10,-1,-6,-1,-1,-7,-8,-6,-9,3,6,5,-30,-14,-6;
MA   /M: SY='G'; M=1,5,-20,6,1,-38,31,-2,-31,1,-30,-27,6,-13,1,0,1,-4,-23,-38,-29,1;
MA   /M: SY='I'; M=-1,-17,1,-24,-16,-1,-27,-14,19,-15,13,13,-17,-18,-14,-16,-7,-1,19,-26,-9,-14;
MA   /M: SY='S'; M=5,2,-10,1,1,-29,2,0,-19,0,-19,-13,8,-2,1,-2,10,9,-11,-35,-20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-5,-20,-6,0,-25,-11,0,-13,8,-12,-10,-2,4,7,11,-1,0,-11,-34,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=7,-2,-13,-2,-4,-36,22,-8,-26,-5,-24,-23,-1,6,-3,-7,6,2,-16,-40,-29,-3;
MA   /M: SY='T'; M=11,0,-3,-2,-1,-20,-7,-4,-10,0,-10,-8,2,-2,0,-4,12,13,-2,-36,-18,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-26,-10,-35,-28,21,-37,-15,25,-20,26,20,-26,-25,-20,-21,-17,-8,18,-8,4,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-18,-3,-26,-26,37,-33,14,-8,-16,0,0,-10,-27,-16,-16,-16,-15,-8,25,57,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-10,-7,-12,-11,-9,-1,-18,12,-14,3,-11,-9,-4,-17,1,9,-6,-6,-13,0,10,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-9,-8,-13,-13,17,-24,31,-15,-1,-10,-6,-2,-19,-2,1,-9,-9,-15,9,37,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-18,-28,-8,-37,-36,58,-45,1,7,-27,15,15,-26,-36,-27,-27,-26,-19,-1,37,47,-27;
MA   /M: SY='R'; M=0,0,-20,2,4,-29,-1,0,-22,6,-21,-17,2,2,6,7,1,0,-17,-35,-21,4;
MA   /M: SY='N'; M=5,11,-11,11,6,-32,3,2,-25,3,-25,-17,17,-5,4,0,13,10,-16,-37,-20,5;
MA   /M: SY='R'; M=-1,0,-25,0,7,-29,-8,7,-19,24,-19,-10,8,-10,16,25,1,1,-17,-37,-20,8;
MA   /M: SY='D'; M=1,9,-21,14,13,-24,-9,-2,-19,3,-19,-14,5,-9,6,-1,-1,0,-13,-34,-19,10;
MA   /M: SY='D'; M=3,11,-18,16,15,-32,1,0,-24,4,-24,-18,8,-6,9,0,3,2,-16,-38,-24,11;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-24,-17,-32,-25,17,-37,-16,23,-18,30,23,-25,-21,-17,-19,-18,-9,16,-11,0,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-6,-31,-26,16,-30,-12,16,-17,19,16,-23,-24,-17,-16,-16,-9,11,-7,4,-18;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
//